Положения ЕС с гигиеническими требованиями относятся ко всем субстратам животного происхождения, не пригодным для потребления человеком. В зависимости от степени опасности, субстраты поделяют на три категории. Материалы из третих стран всегда должны проходить стерилизацию.
В частности эти положения регулируют:
- вид обработки, который будет применяться (стерилизация, гигиенизация),
- нормы разрыва между зданиями биогазовой установки и животноводческими цехами,
- обязательства пл контролю и документации,
- очистка и дезинфекция транспортных средств и резервуаров, которые попадают за пределы территории биогазовой установки.